教育部長吳茂昆今（29）日證實他已向行政院提出請辭獲准，並聲明在野黨立委對他的羞辱與不實指控，已經影響到教育部行政同仁。對此，中國國民黨籍立委柯志恩稍早於辦公室外受訪回批，如果吳茂昆個人沒有值得攻擊的事，大可繼續留在位子上，不應強調是在野黨攻擊才下台。
吳茂昆於4月19日上任，當月27日教育部即宣佈駁回台大校長遴選結果，不予核准獲選人管中閔的人事案；國民黨眾多立委於4月30日便直攻教育部並佔領部長室，立委陳學聖多次在教文委員會現場要求吳茂昆離席、柯志恩更於日前在質詢台上披露，吳茂昆曾經於擔任國科會主委任內，赴中國杭州國際技術高峰會議，卻未向國內申報此行程，違反相關法規。
柯志恩今日受訪進一步指出，吳茂昆曾說他是一個「沒有什麼過錯的人」，從頭到尾不認為自己有違法，但無論是上任前後被揭露有侵害東華大學學生專利的疑慮，或是她所披露的杭州交流爭議，都是吳所始料未及的，還認為一切都是誹謗。
針對台大遴選事件，柯志恩表示，教育部用跨部會的「洪荒之力」向管中閔追殺跟攻擊，才因此搞掉2個部長（含前任部長潘文忠），行政院勢必要對這件事情的釐清疑點，管案本身更要回歸到行政面，看台大遴委會與校方如何接招。柯志恩強調，管案非常單純，沒有人打算為此搞掉2個部長，是教育部的作為讓大家不能理解，這才是2位部長請辭的根本原因。
至於下一位教育部長的人選，柯志恩表示，她個人認為新部長很難找到，沒有大學校長想在管案沒有徹底釐清解決之前，會願意上來接這個燙手山芋，而國教體系出身的部長也很難對大學教育提出見解。柯志恩呼籲，希望教育可以回歸專業，期待新教育部長上台後，能夠秉持中立的角度，跳脫藍綠，好好看待管案與國教議題。