媒體報導，雖然現任中研院長任期到今年十月，但馬總統恐趕在五二○卸任前，任命新任中研院長，其中院長候選人更有統派色彩甚深的馬友友，即外傳馬英九總統的高中同學、香港城市大學校長郭位，是馬總統任命為下任中研院長熱門人選。
對此，立委管碧玲踢爆，郭位去年九月三日曾前往北京參加中國的九三閱兵，該團團長就是香港特首梁振英。立委並質疑，郭位過去挺核電、未積極捍衛民主的言行，嚴重與台灣社會脫節，甚至協助中國發展新藥產業，在國民黨幾乎打趴台灣生技業的同時，若再讓郭位擔任中研院長，非常不恰當。
更可議的是，由於我國於一月十六日完成總統大選，已產生新民意，馬總統此時若不願「看守」，強硬任命十月才上任的中研院長，將使新任中研院長有「民主正當性」欠缺的憲法問題，且因中研院長的任期五年，形同剝奪下屆總統的人事任命權。
因此，立法院應亡羊補牢，針對中研院組織法之不完備，進行修法，這不只是避免馬總統踐踏憲法民主原則，更是健全國家民主體制的必要作為。
依據現行中研院組織法第3條第2項規定「院長，由本院評議會就院士中選舉候選人三人，呈請總統遴選並任命之。」及第4項「院長任期五年，連選得連任一次。」，確實未明定總統任命院長的時程，這才讓馬總統有偷渡的機會，形成馬五二○已卸任，但馬任命的中研院長十月才上任的反民主現象。
所以，立法院應修正中研院組織法，法制化中研院長的任命時程，舉例而言：檢察總長的任命，法院組織法第66條第8項「最高法院檢察署檢察總長由總統提名，經立法院同意任命之，任期四年，不得連任」及第13項「最高法院檢察署檢察總長於任滿前一個月，總統應依第八項規定辦理。」即明確規定，總統應於檢察總長任滿前一個月，由總統提名檢察總長，經立法院同意任命之。換句話說，「一個月」是總統提名下屆檢察總長的作業時程。
此外，對於首長人事出缺時，也於法院組織法第66條第11項規定「最高法院檢察署檢察總長因故出缺或無法視事時，總統應於三個月內重新提出人選，經立法院同意任命之，其任期重行計算四年，不得連任。」，即對於首長任命之時程有較周延之規範。
然而，現行制度的中研院長任命，卻無明確時程規定，此為立法之不完備，更導致馬總統有違反民主的操作空間，恐演變成馬總統今年五二○已卸任，但馬任命的中研院長十月才上任的荒謬現象，這樣的中研院長不只民主正當性不足，更衝擊責任政治的憲法原則，新國會應儘速修法補正，明確化中研院組織法關於院長任命的時程規範。