台北市政府指控遠雄大巨蛋施工不當，導致緊鄰大巨蛋的松山菸廠鍋爐房地基下陷、煙囪傾斜，因而向遠雄巨蛋求償損失246萬8647元。台北地方法院今（14）日判決出爐，認為遠雄巨蛋僅須賠新台幣75萬8417元，但全案仍可上訴。北市府得知後則表示，北市府尊重司法判決的結果，這也證明松菸古蹟確實有受大巨蛋工程影響，盼後續遠雄能妥善修繕維護。
北市文化局指控，遠雄巨蛋公司未依工程合約施工，導致松菸文化園區鍋爐房的煙囪傾斜、地層下陷，承租該區的三井選品公司因而解約、退租，市府並指遠雄在2014年2月曾在施工現場進行混凝土灌漿補強地盤，顯見當時是因大巨蛋施工造成地層下陷，因此向遠雄巨蛋求償246萬8647元。
法院認為，北市文化局向遠雄巨蛋求償的時間點，為民國103年2月21日至104年3月1日止，不過，遠雄巨蛋於103年7月，在鍋爐房地坪挖掘出疑似地下舊有構造物，需等待文化局的勘驗評估、討論審核修復計畫，迄今尚未回覆。
也因如此，北市文化局要求遠雄巨蛋賠償，103年7月1日至104年3月止損失的鍋爐房使用費167萬2310元，法官認為難由遠雄巨蛋負責，駁回此部分請求。
此外，北市文化局向三井公司收取3萬7920元的使用費，並依法納稅，未退還給三井公司，文化局並無任何營業稅損失，遠雄巨蛋不需負擔；扣除上述2筆金額，法官最終判處遠雄巨蛋賠償75萬8417元。
對於求償金額與判賠結果差距甚大，北市府發言人林鶴明表示，北市府尊重司法判決的結果，但這也證明松菸古蹟確實有受大巨蛋工程影響，盼後續遠雄能妥善修繕維護。