空軍清泉崗基地驚爆大批安非他命毒品案，國防部今天在一場記者會中指稱「依照過去經驗來看，有不少初篩呈現陽性反應者，最終調查發現是使用中藥、感冒藥等藥材的案例」，此話一出，中醫師公會全國聯合會怒批國防部不思檢討軍紀與革新犯罪預防措施，卻卸責給中醫藥，誤導視聽。衛福部中醫藥司也指出，從來沒有任何文獻報告指出中藥含有安非他命成分、或吃中藥驗出安非他命的報告，希望國防部要了解實情。
衛福部中醫藥司科長陳聘琪表示，若有官兵篩檢出安非他命毒品反應，希望國防部了解實情，釐清檢驗結果是陽性或偽陽性，如果陽性就要去找出真正原因。而這個錯誤資訊也希望能立即更正，讓消費者知道，免得以後消費者不敢吃中藥，擔心吃了中藥在路邊被抓去驗尿，這誤會就大了。
陳聘琪表示，從來沒有任何文獻報告指出中藥含有安非他命成分、或吃中藥驗出安非他命的報告，實在不理解國防部會為什麼會這樣說。
中醫師公會：國防部不要卸責
中醫師公會全國聯合會秘書長柯富揚強調，這次國軍蒙羞的毒品丟包事件主角是「安非他命毒品」，中藥沒有任何文獻會驗出安毒的陽性反應。
柯富揚說，中藥材中唯一可能與毒品扯上關係的是麻黃，但在一般處方中，不可能吃得到屬於毒品的高濃度麻黃素。即便是西醫的感冒藥甘草止咳液，感冒藥水成分中的可待因，還有麻黃素的衍生物，也不會驗出安毒陽性反應，他重砲轟「國防部不要亂卸責了！快查軍紀吧！」
中醫師公會全國聯合會認為國防部試圖以中藥做為掩蓋國軍毒品醜聞案的卸責之詞，因與事實真相不符，且在缺乏完整論述與臨床實證下，恐引發民眾對於中藥材之恐慌與誤解，發布3點聲明：
一、無論任何中、西藥，都須針對個別病人之體質及病況，經中、西醫師診斷開立處方箋後，始得服用，合先敘明。
二、任何司法偵審機關將毒品案之被告尿液等檢體送複驗後，其複驗報告所呈現之數據資料，絕無可能出現與中藥材有關之名稱與數據，當前更無任何醫學文獻指出，服用中藥與毒品檢驗呈陽性反應有關聯性。
三、國防部對於國軍毒品醜聞案，不思檢討軍紀與革新犯罪預防措施，率爾卸責予中醫藥，有失實事求是之科學精神，亦難獲得國人諒解與認同，本會表達嚴正抗議之餘，更請行政院與監察院主動介入查察，釐清真相，避免爾後再生此類事件，以維護我國醫療形象。