復興空難目前尚有12名乘客下落不明，台北市長柯文哲決定今（6）日上午7時，動員警、消、國軍、消防署特搜隊、空勤總隊及海巡署人力、機具，展開大規模搜索行動。
今早的擴大搜索行動，由台北市政府副秘書長薛春明擔任現場指揮官，動員的單位除北市警、消人員外，國軍、新北市、金門縣、宜蘭縣、基隆市、消防署特搜隊、空勤總隊及海巡署均派人力機具協助，預計動員457人，含94名潛水人員，48車輛、163機車、44船艇，全力投入搜索行動。
國防部和內政部空勤總隊預計出動6架直昇機，於百齡橋上游1公里至淡水河出海口5浬間的空域，進行慢速目視空中搜索，關渡宮至淡水河口出海口10浬內，由海巡署以船艇進行目視搜索。
事故現場至大直橋間、南湖大橋至關渡宮、淡水河口大規模搜索
柯文哲表示，昨天晚上就決定擴大搜救範圍，今天早上7點已按照原訂計畫搜尋，一個是從出事地點到大直橋，派潛水人員下去作深度探索，另一個是從事發地點一直到關渡宮，這是屬於台北市的範圍，出動消防局氣艇及警察分別進行河面及岸邊搜索，至於新北市的部份，是從淡水河口往關渡宮這邊查過來。
柯文哲指出，今天早上已和水利署開過會，由鄧家基副市長代表出席，因空難是由交通部主責，指揮權交給中央，台北市政府會全力配合，至於目前的搜救計畫是否需要修改，下午1點由中央接管指揮權後，會再開會討論。
柯文哲說明，因夜間無法進行水面作業，而且基隆河太混濁，白天都看不太清楚，更何況是夜間，如果是要救人，當然是全力搶救，但他認為現在是要找出遺體，不願讓救援部隊面臨太多危險，今天早上7點天亮後才繼續作業。
對於破水門花了3個小時是否有檢討空間？柯文哲解釋，有些事是預料不到的，從來沒想到必須在河堤內動員400及700噸的吊車，「而且台北市的堤防其實做的滿堅固的」，再加上空軍部隊是從桃園移過來的，在當時的條件下已盡了最大速度，至於事先沒有想到的部份，事後會再檢討。
柯文哲說，依災害防治法，空難的主責單位是交通部，但在第一時間，北市和新北市就立即處理，沒有逃避責任，先救人再說，至於指揮權就等中央準備好再移交，北市府還是先照預定計畫進行。
柯文哲強調，第一時間，北市和新北市不分彼此，全力救災，這是最重要的，這樣態度要先建立，至於檢討工作應等事後再進行，但有時常淪為政治口水，「我也不是很喜歡大家討論這種事情」，他昨天早上就下令研討會開始蒐集各局處檢討改進資料，最重要還是救人，還有12人沒找到，對家屬而言是很大的折磨，他查過數據，遺體恐怕都漂到外海，但講白一點，人死要見屍，一定要找出來，給家屬一個交待。