綠色和平今（20）日表示，去年於模里西斯共和國調查全球非法漁業中，發現至少有10艘台灣籍漁船未登記於印度洋鮪類委員會（IOTC）授權名單；歐盟於2015年將台灣列為打擊「非法、未報告、不受規範（IUU）漁業」，不合作第三國警告名單（黃牌名單），綠色和平也呼籲，漁業署應積極行動、打擊非法，讓台灣能脫離歐盟黃牌名單。
儘管台灣在被歐盟列入黃牌名單後，為了避免被歐盟改舉紅牌，從其他國家解除黃牌危機作法分析，不僅在法規面改善，新增遠洋漁業條例，並加設電子系統，成立24小時漁業監控中心，掌握漁船動態，但綠色和平在2017上半年前往模里西斯調查印度洋漁撈作業，仍發現有多艘的台籍漁船和權宜船，並不在該年的印度洋鮪類委員會漁船名單與漁業署權宜船名單中，卻疑似於印度洋從事違法捕撈作業。
綠色和平表示，最令人不解的是，有些漁船在中西太平洋漁業委員會（WCPFC）有登錄資料，即表示漁業署應可掌握這些漁船資訊，卻未能從監控系統發現這些不在IOTC名單中的漁船出現在印度洋，時間可能還長達近一年之久。
綠色和平海洋專案負責人李宜蕎表示，去年綠色和平已發現監測中心無法監管非法轉載漁獲，這次調查結果更顯示，監控系統沒有反映出所監控的漁船，出現在未經核准的捕撈區域，即使漁業署核對名單後也仍有出入，希望漁業署儘快確認漁船是否違規並確實執法，以保障合法漁船的權益。
鑑於去年歐盟仍以執法待加強為由，將台灣繼續留在查名單中，綠色和平表示已主動提交本次調查結果給漁業署，期待漁業署貫徹執法，並能在近期歐盟官員來台訪查離開前，公開調查程序，提供調查作業時間表，向社會與國際展現取締非法漁業的成果，避免因少數漁船違法加深台灣漁業負面形象。
另外綠色和平本次調查也發現疑似違規的權宜船（船籍登記於他國），綠色和平建議，漁業署若欲真正管理權宜船，防堵非法漁業發生，應於每艘漁船增設國際識別碼，如水上行動業務識別碼（MMSI）或IMO，並與船籍國通力合作，同時了解他國的作業規範與法規，相互支援，才能抑止違法事件發生。
若遭歐盟列入「黃牌」警告名單而未於期限中改善，則歐盟將會祭出「紅牌」制裁，禁止漁獲出口至歐盟，過去曾被列入黃牌名單的韓國、菲律賓，花一年半從黃牌除名，原本漁業署預期台灣能在一年半內從名單解除，但台灣至今仍於警告名單中；歐盟官員日前再度抵台訪查，預計21日將會讓台灣了解是否解除黃牌警告。