中研院院長翁啟惠今(27)日二度因浩鼎案到立院備詢，多數立委圍繞在翁啟惠該不該辭職以及與浩鼎之間的關係，但中研院出身的時代立委黃國昌則是把砲口指向中研院的內規，質疑中研院的技術轉移規定設計竟是「有利害衝突」才揭露，而不是一般「有利害關係」才揭露，違反了法規設計的原則與概念，要求中研院一定要搞清楚，否則未來類似浩鼎的錯誤還會繼續發生。
日前中研院在說明院內《技轉利益衝突迴避原則》指出，若當事人在執行技轉過程中，未與受移轉公司發生利益衝突，就不必揭露。而上次翁啟惠赴立院質詢時，也遭民進黨立委鄭麗君質疑，翁啟惠若已經知道女兒翁郁琇已經持有浩鼎股票，那麼當中研院在技術轉移時，就應該知道有「利益關係」，當初應該要申報。
對此，中研院出身的時代力量立委黃國昌今日直指中研院針對技術移轉規範的漏洞，認為這將會使技術移轉過程中出現法規遵循的錯誤，反倒對翁啟惠的部分僅表示，「院長的案子進入司法、檢調的程序，我相信大家都尊重司法檢調的調查結果。」
黃國昌以媒體報導中研院針對技術移轉利益衝突迴避原則說明的報導表示，聽到中研院智財技轉處長楊富量日前對技術移轉利益衝突迴避的說明，「感到非常驚恐」，黃國昌強調，因為一般在利益迴避的規範上，「基本上只要是利害關係人，有利害關係就得揭露」，但現在中研院的作法，從媒體報導上看起來，似乎是有「利益衝突」才要揭露。
黃國昌質疑，中研院現在是真的按照媒體上說明的這套機制在運作嗎？楊富良則回應，技轉相關作業一切依法規和契約執行，就現行規定為當事人執行科技移轉業務時，因其作為或不作為，直接或間接使本人或其關係人獲取利益者，應揭露可能發生利益衝突情形，但並未正面回應黃國昌質疑。
黃國昌表示，在利益迴避原則上，一般法律認知上都是「有利害關係」就要揭露，至於揭露之後，雙方是否有利害衝突，則必需要由一個獨立的組織體去判斷」，但中研院的講法，違反了法律原理，此事若沒有釐清，類似這次犯的錯誤，以後會一再發生，此時中研院院長翁啟惠也一度站起來要幫忙說明，但黃國昌卻要翁啟惠坐下休息，認為「站了一天也很累了」。
此外，對於中研院科技移轉利益揭露表的二等親中，漏列子女一事，中研院過去對外表示是基層法務人員疏失，黃國昌也不滿表示，公文層層上去、相關主管都有蓋章，現在卻把責任推給基層的法務人員，這令人很難接受。