無黨籍台北市長候選人柯文哲與國民黨台北市長候選人連勝文今（7）日晚間首次在電視辯論，在交叉詰問時連勝文質疑柯文哲「墨綠」及當選後釋放陳水扁，柯文哲則在答覆則說，連市長郝龍斌都贊成扁保外就醫，他更強調，「讓阿扁死在監獄中，符合台灣社會最大利益嗎」？
對於被質疑「墨綠」，柯文哲幾次動氣，接連說到幾個「但是」都加重語氣。柯文哲更提到連勝文和阿扁「都是我的病人」，反批連現在說他「墨綠」是撕裂社會，為了個人政治利益。
連勝文提問時質疑，柯文哲曾說自己不是淺綠而是「墨綠」，也曾說當選市長就是釋放扁最好的時機，而柯又說現在不算，重新開始（reset）。他批評柯文哲，「山寨機重新開機之後，還是山寨機，而不是iPhone」。
柯文哲答覆連勝文說，他說自己是「墨綠」，「當時是為了向這個社會證明你的槍傷是真的」，「我這樣講是為了台灣社會的和諧，可是你今天在講我是墨綠的時候，你是在撕裂這個社會，謀的是你個人的政治利益」！
柯文哲說，「我看待陳水扁，跟看待你一樣！你們都是我的病人。做一個醫生，你們就是病人而已！我在對陳水扁也是這樣」，有關過去對陳水扁的講話，「我說阿扁病人，說阿扁有精神病，說阿扁是個廢人！我講的有不對嗎？我和台北榮總、台中榮總診斷書，有哪個地方是不對的」？說到這裏，柯語氣都特別加重。
柯文哲說，後來二十一個中研院院士也都聯名簽字，「醫學上阿扁的問題不用再去討論，他就是個病人，他已經變成廢人了！」，「但是！」，「如何處理這個問題，這是可以討論的」。他說，做一個台灣的知識分子，他是扁的醫生，對扁的醫學問題做說明。
「但是！」，柯文哲繼續說，「郝市長也坐在這裏，連郝市長都主張保外就醫，我還沒講那麼清楚，我只是呼籲說，「讓陳水扁死在獄中，符合台灣社會最大利益嗎」？「政治問題大家要有政治智慧去處理」。
連勝文在提問時批柯文哲，北市最重要的環南市場要重改建，「你也用重開機的態度看待」要攤商搬到河堤外，這些攤商只要遇到颱風、下大雨，就必須在堤防內外搬來搬去，「你的重開機不就是在欺負攤商，造成消費者不便嗎」，柯又說劃掉五千個停車位，又是要重開機，「將來做錯就是要重開機，市民就是這樣倒楣被折磨嗎」？
柯文哲答覆時指出，環南市場是穿西裝、改西裝，他主張一次改建，「不要花十年」他說自己做一個外科醫生，「本來就比較急，想說能不能一次解決」。事實上搬到河灘地，遇颱風可能要停市二、三天，這他非常清楚，但這是一種討論，甚至換個地方去也可以。
柯文哲話鋒一轉說，在政治上對與錯，大家可以討論，「但是！我是一個相信良心的人，我常講我在加護病房工作三十年，當加護病房的門關上時，只有上帝知道你在做什麼」，他強調自己一直很相信良心，在這場選戰中，他都跟支持者講說，只有二個原則：心存善念、盡力而為，希望大家都用同樣的態度打選戰。