台灣基督長老教會總會常置委員會通過決議，表明支持1020喜樂島聯盟發起的「拒絕中國霸凌－全民公投反併吞」活動，不過，長老教會同時也肯定總統蔡英文的雙十談話宣示「捍衛台灣自由民主的現狀」，及蔡英文執政以來，堅持「捍衛台灣主權獨立」的現狀，在轉型正義、年金改革、不當黨產以及前瞻基礎建設計劃的成效。
長老教會總委會16日召開臨時會議，通過「台灣基督長老教會參與『拒絕中國霸凌－全民公投反併吞』活動聲明」，譴責中國政府非法否認台灣國家主權獨立的事實，一方面對全世界說：台灣是中國不可分離的一部分。二方面以各種方式阻擾、斷絕台灣參與國際的空間。
對於10月20日喜樂島聯盟發起在台北市舉行的「拒絕中國霸凌－全民公投反併吞」活動，台灣基督長老教會三千多位牧師、長執及信徒，以堅持台灣主權獨立，反對中國霸凌併吞之一貫精神參與。
長老教會也感謝美國副總統彭斯，日前在華府智庫哈德遜研究所演說，指控中國對美國政策和肉政的干預，及主導三個拉丁美洲國家與台灣斷交，長老教會肯定彭斯的洞見，並期待在〈台灣旅行法〉的精神下，歡迎彭斯訪問台灣。
不過，有別於喜樂島對蔡英文的批判，長老教會則是肯定蔡英文雙十文告中宣示「捍衛台灣自由民主的現狀」，並建立「台灣不可取代的區域戰略重要性」，以及針對台灣與中國的現況，發表「四個不會」原則：不會貿然升高對抗；不會屈從退讓；不會因一時的激憤，走向衝突對抗，使兩岸關係陷入險境；不會背離民意，犠牲台灣的主權。
台灣基督長老教會在聲明中表示，肯定蔡政府執政以來，堅持「捍衛台灣主權獨立」的現狀，並以公平正義的原則在轉型正義、年金改革、不當黨產以及前瞻基礎建設計劃有顯著的成效。
台灣基督長老教會再次告白「釘根在台灣本地，認同所有的住民，通過愛與受苦，成為盼望的記號」之信仰，以及長久以來主張「使台灣成為新而獨立國家」的精神，我們堅定與全體國民共同宣告－「拒絕中國霸凌及併吞，建立台灣獨立新國家」！