高鐵新增的苗栗、彰化、雲林等三站將於今年底完工通車，配合新增三站加入營運，台灣高鐵年底班表將進行大調整，而因為增加三個停靠站，高鐵行車時間將拉長，停靠站愈多之票價有望較停靠站少的班次便宜一些。
高鐵局長胡湘麟3日表示，日本高鐵就有對不同停靠站實施不同票價，高鐵新增三站後若停靠車站變多，行車時間會拉長，其服務水準就與現在不同，在票價上應該有所差異，他已向高鐵執行長鄭光遠提過此事，相信高鐵公司會對此進行討論。
台灣高鐵公司發言人劉文亮表示，現在高鐵票價是每公里基本運費乘以里程數，三站加入營運後，仍會依起迄站的距離來計算票價，現在公司內部已針對新的班表進行評估，完成後會依合約向交通部高鐵局提報。
他指出，現在的直達車營運模式在未來不會取消，且預期新增三站後旅客量會增加，所以總班次也不會減少，只是停靠站的模式會進行調整，至於停靠站較多的班次票價是否給予折扣，也會進行研議，並提報董事會討論通過，再向高鐵局提出。
據指出，目前台北到高雄左營票價為1,630元，高鐵局希望停靠站較多、其服務水準較低，票價應低於停靠站較少的班次，就如同搭飛機一樣，到歐美直達不中停的機票就是比中停一站上下客的航班要便宜許多，至於折扣多少，高鐵局尊重台灣高鐵公司的規劃。
目前高鐵有八個車站，台北出發停靠板橋、台中後抵達高雄左營的直達車僅需96分鐘，其他列車則是選擇幾個車站停靠（即跳蛙式停站方式），若新增三站而每站都停的話，整個行車時間將長達150分鐘，高鐵就會變慢鐵，高鐵局不建議這種營運方式，希望高鐵公司以不同的停靠站方式，來服務每座車站的旅客。
