教育部駁回台大校長遴選案，要求台大重啟遴選，但台大校長遴選委員會對外表示無法接受駁回、拒絕重啟遴選。教育部長吳茂昆今天（30日）受訪時表示，教育部基於尊重大學自治的精神，才將全案退回到台大遴委會，如果台大校長遴委會拒絕重啟遴選，台大應該要召開正式校務會議討論解決。
台大校長遴選委員會選出管中閔接任校長，被教育部以「有重大利益未迴避的適法疑慮」理由駁回，並要求重啟遴選，但台大遴委會發言人袁孝維今天對外表示，遴委會己聲明重無法接受駁回，除非有合法的理由，否則不會重啟遴選。
吳茂昆受訪時則表示，如果遴委會決定不重啟遴選，台大應召開校務會議來討論這件事。大學校長是遴選不是選舉，有人誤以為像中選會一樣，選出來就要通過，但遴選是要經過資格審查、找出最適法且最合適領導大學的人，不是用民粹選舉來決定，近年來，大學校長遴選出現紛擾，與認知有誤有關。
吳茂昆表示，管中閔教授當選校長有適法性問題，教育部請台大根據這些資訊去檢視，這是遴委會該做的事，這裡面有基本的公平公正，遴委會是受台大校務會議委託，遴委會如拒絕，就須由校務會議做決定，台大校長應該召開正式校務會議討論此事的後續，才是回到大學自治的基本精神。
對於被批評干預大學自主，吳茂昆表示，教育部從來沒干預大學自主，遴選就是希望遴選委員會找出最好的人，這個人需要被很多標準檢視，然而台大遴委會在整個遴選過程並不完備，「違背了遴選委員自己訂的規則」，有學術誠信的問題，因此最後的結果教育部當然不能接受，要求台大回去把遴選過程做得更完備。