台北市長當選人柯文哲7日拜會宜蘭縣長林聰賢後表示，不放棄爭取北宜直線鐵路通過翡翠水庫最短路線的方案，至於環評問題將交由專業來解決。對此，環保聯盟創會會長、台大教授施信民表示，不論是「直線」或「繞道」都沒有興建的必要，最佳作法是在現有的鐵路提升行車速度，他強調，交通路線不只考量時間，還包括生態環境、人民便利性及工程難度等因素，呼籲柯文哲完整了解後再發表意見，以免降低發言的可信度。
有關北宜鐵路的規畫有二方案，最早是於2005年採取最直線的最短路徑，從南港穿越翡翠水庫集水區至頭城，全長36.3公里，行車時間約39分鐘，但在2006年5月19日遭環保署環境影響評估委員會作出「不應開發」決議，建議另尋替代方案退回。
交通部鐵路工程局今年4月另提方案二，由台北南港經宜蘭雙溪、大溪至頭城，全長53公里，行車時間約47分鐘，和行車時間最少、速度最快的第一方案差8分鐘。
新科台北市長柯文哲說，從台北市政府開車到宜蘭縣政府只要1小時，針對北宜直線鐵路，他和林聰賢已有共識，將推翻原先的南港經雙溪到頭城的路線（方案二），共同爭取行車時間最少、速度最快的第一方案，至於新路線經過翡翠水庫的環評問題，將交由專業來解決。
交通規劃不只考量時間 國道3號路線為明例
對此，身兼柯文哲環保局長遴選委員召集人、台灣環境保護聯盟創會會長、台大化工系教授施信民，在接受民報電話訪問時表示，所謂「最短路線」的北宜直鐵方案，穿越自來水、飲用水等水質水量保護區，又經過九條斷層，靠近台北處是環境敏感區位，又有宜蘭端考古遺址，在2006年的環評就被否決了，只要環評沒過，就沒理由興建。
施信民指出，方案二避開水庫水區，交通部原本預計今年底提出環評，但眼看今年就要過了，卻還沒送環評，施信民認為，不論是「直線」方案一或「繞道」方案二的鐵路規劃都沒有必要，均會造成生態環境的破壞，國家預算不應花在這上面，應在現有的鐵路提升行車速度，才是最佳方法。
施信民強調，交通路線的選擇，考量的因素不只是時間，還包括路線對生態環境的破壞、是否有助於人民便利性、親近自然環境以及工程的難度等。他以高速公路的興建為例，國道1號路線採直線設計，但北部內陸人口很多，上國道1並不是很方便，而國道3號的路線，在北部時靠近山區，到了新竹、彰化時卻是往海邊去，是為了方便海邊的人使用，而彰化後又轉進內陸，雖然有點浪費時間，但路線的設計是以各地民眾使用的便利性為考量，而非為了節省時間。
施信民進一步表示，柯文哲一再強調，在開發和環保之間，他較重視環境保護，這理念當然很好，但很多事，他以前並未關心，對他而言是新的議題，應在完整了解後再表示意見，尤其是要對具體個案的事實好好了解，才不致使說出來的話和他的理念相衝突，否則時間久了，他發言的可信度將會降低。