針對國民黨副總統候選人王如玄今天在電視政見辯論時，暗諷前中研院院長李遠哲要為教改失敗負責，民進黨副總統候選人陳建仁辯論會後表示，有關教改問題，執政黨已經執政八年還沒有做好，竟歸咎九七年的報告，歸咎於國際頂尖知名學者這是不負責任作法，相信社會應該自有公平，可以去問問大家的意見。
對於台南登革熱疫情控制問題，陳建仁說，登革熱防治原本就是應該中央與地方一起合作，任何防疫沒有中央與地方合作，不可能克服。他表示，南部縣市在北迴歸線上，本來病媒蚊就多。
這次台南市爆發疫情，他記得中央還說過沒有一萬例，由地方負責疫情防治。他當署長時，登革熱並沒有流行，衛生署就主動去撲滅病媒蚊，防疫最害怕是政治口水，如果一直有政治口水，要防疫就很困難。