5月6日世界衛生組織（WHO）祕書長陳馮富珍寄給衛生福利部長邀請函，有為中共「一中原則」張目的陰謀。面對中共企圖限縮台灣國際參與的敵意，新政府應該展現新外交思惟，丟棄馬英九的外交休兵，重返國際社會。
為配合北京對台灣新政府施壓，馮的邀請函竟然捏造聯合國大會2758號決議及世界衛生大會25.1號決議展現「一中原則」，以誤導國際社會台灣是在接受「一中原則」情況下以觀察員身分參與第69屆世界衛生大會。
對此新政府發言人僅表示「聯合國大會2758號決議文與一中原則，也沒有直接關係，台灣的參與不應受任何政治框架的限制」；但台灣必須更積極更有效反制WHO及背後黑手。馬英九下台前曾透過總統府發言人表示邀請函意味兩岸過去8年來，基於九二共識、一中各表善意互動的延續。馬也肯定WHO邀請函，與北京隔海唱和。
5月11日中共國台辦發言人馬曉光說「一中」原則得到國際社會普遍承認，聯合國大會2758號決議與WHA的25.1號決議都體現這一原則。他並表示在兩岸關係和平發展的背景下，從2009年起，台灣得以參與WHA是在一個中國原則下作出的特殊安排。他警告說「挑戰國際社會公認的一中原則，相關的安排將難以為繼。」
北京及其在國際組織的代理人故意誇大和錯誤解讀聯合國2758號決議案，設局誤導國際社會積非成是的認知已是「累犯」，在2007年我國在「CEDAW」存放事件中，聯合國秘書長潘基文就在他的信件中聲稱聯合國2758號決議案認定台灣是中華人民共和國的一部分。這一信件被前副總統呂秀蓮發現，提醒陳水扁總統及時搶救，由當時駐美代表吳釗燮向美國國務院嚴正表達我國立場，美國因而訓令其駐聯合國代表團強力介入。陳水扁總統當時也致函潘基文嚴正指出，「聯合國2758號決議文並未賦予中華人民共和國在聯合國代表台灣人民，更未提到台灣是中華人民共和國的一部分」。最後潘基文向美國駐聯合國代表Zalmay Khaliad承認聯合國秘書處不當詮釋第2758號決議文，「並保證聯合國爾後不再犯同樣錯誤」。
WHO是聯合國所屬的組織，對於已經由聯合國祕書處正式認錯的詮釋，仍繼續擴大解釋，是因北京在幕後操縱。2009年立委管碧玲曾爆料國共合作，讓中國與世界衛生組織密簽備忘錄(MOU)，確立台灣參與世界衛生大會(WHA)的「宗主國模式」。當時管碧玲提出來自國際組織提供的世衛內部機密文件，證實世衛與中國在2005年已簽定備忘錄，香港籍WHO秘書長陳馮富珍辦公室更曾對世衛所有會員發出「世衛條例對中國台灣省之執行作業準則」秘密信函，把台灣在國際條約上定位為「中國的一省」。
2007年美國針對潘基文信件曾發表幾點嚴正聲明，指出(一)聯合國文件「台灣是中華人民共和國不可分割的一部分」的主張雖然符合中國立場，惟「並非美國在內之聯合國會員國普遍接受之主張。」(二)聯合國大會1971年的2758號決議，僅承認中華人民共和國為在聯合國代表中國之唯一合法政府，並驅逐代表在聯合國及所有相關組織佔據之席次，並未提及中國對台灣擁有主權。
日本、加拿大和多數歐盟成員國，也都採取類似立場否定並潘基文的不當解釋，顯然國際社會並未普遍承認北京的「一中原則」。
美、日及歐盟等許多民主國家已表態支持台灣參與即將於5月23日在日內瓦舉行的世衛大會。此後北京仍會繼續在其他國際組織阻撓及矮化台灣的參與。
民進黨政府不同於馬英九政府不能臣服北京，不可奉中國為台灣宗主國。為一勞永逸，新政府即應提醒美、日、歐洲及我友邦，對WHO秘書處，尤其是為虎作倀的港籍馮秘書長提出嚴正抗議，敦促她和新任秘書長不可再聽命於中國，為排斥台灣而破壞WHO的公正性、制度及效能。