台大今（12）日召開第二次臨時校務會議，討論校長遴選結果遭教育部駁回一案，台大校務會議代表、音樂系教授沈冬表示，教育部的來文簡直就像是叫學校吞下不平等條約，也不尊重辛苦的遴選委員，籲請教育部盡快聘任管中閔；不過法律學院學生會長童昱文反駁，表示台大若於程序上不合法，教育部也不需尊重違法決議。
參與「台大自主聯盟」的教師沈冬說，自己不懂法律，但針對教育部的正式來文，也許自己是學文學的所以比較浪漫，對於她來講簡直就像是叫我們吞下一個不平等條約，對於我們很辛苦選出來的遴選委員非常不尊重，基本上否定了我們辛苦選出的校長。
她說，教育部否定台大提出的報告，寧可相信網路傳言，透過媒體騷擾台大跟行政單位，所有老師都被用得無心研究與教學，大家也許會想說教育部怎麼會是敵對的一方，但是教育部這就是侵害台大的精神，校園學術自由、大學自主自治的精神。
沈冬表示，這兩天才讀到史丹佛大學如何發揮想像力等等，但沒有提到如何面對外界強橫的力量，我們台大都是社會的菁英，應該要勇敢告訴教育部我們不要這個平等條約，重啟遴選曠日費時，教育部也不一定會接受，及大家不願打行政訴訟下，呼籲教育部盡快聘任管中閔。
她說，台大為了校長遴選付出許多心力、金費，但教育經費卻一直下降，教育部的來函裡沒有對於利益迴避的說明，若遴選委員會根據現在的辦法進行，可以說有違法嗎？到底要怎麼做才沒有違反程序，才沒有違法？台大真的需要校長，這個責任實在是太大了。
對於沈冬的發言，台大法律學院學生會長童昱文反駁表示，沈冬老師提到史丹佛校長想像力的重要，但「法律問題不是可以用想像來解決的」，他說，特別法優先於行政程序法，但大家不要忽視法律位階，行政程序法跟台大的遴選辦法有上下位階，不代表可以排除適用。
童昱文表示，最後還是回到兼職的問題，通例不能作為法律依據，兼職期間要跟契約一樣，即便這個東西是對的，也不能在契約還沒訂定之前而溯即他的效力；童昱文說，最後剛剛沈冬老師說到教育部不尊重台大，「台大若程序上不合法，我想教育部不需要尊重違法決議」。