有關國安局兩大外圍組織「遠景基金會」及「亞太基金會」，據悉，其中民進黨前主席許信良將出任遠景基金會董事長;前民進黨中國事務部主任、健行科技大學企業管理學系教授顏建發出任亞太和平基金會執行長。
趙春山為現任遠景基金會董事長，蔡英文就任後，計畫將原本就是她長期以來在兩岸關係請益對象的許信良，正式納入國安系統。
遠景基金會算是國安局對外的智庫，基金會設董事會，由九至十五位董事組成，基金會設執行長一人，由董事長提名經董事會同意後聘任；基金會下設六個執行部門，包括國際交流暨研究、行政、財務、出版、資管及網資組等，以及四個研究群組，包括拉美及非洲（邦交國）研究小組、亞太（東北亞及東南亞）研究小組、美國研究小組、歐洲及其他研究小組。
綠營學者顏建發傳將任亞太和平基金會執行長，他的專業在於東南亞、兩岸研究，曾任職於陸委會諮詢委員、外交部研究設計委員會主委、民進黨中國事務部主任。
亞太和平基金會成立在民國97年，基金會由臺灣朝野菁英及資深學者共同創建而成，目標發展是成為國家級的智庫，主要提供政府及社會各界各項分析意見以及增進兩岸互相瞭解、發展互動關係，以及致力亞太地區和平之研究、提昇國際學術交流與合作等功能。
據指出，蔡英文重新佈局國安局兩大智庫，她對於未來在東南亞政治、經濟及兩岸在政界、學界互動聯絡，已經妥善佈局。