這次總統大選透露出一些關鍵訊息，第一，選後新任執政者更應該謙遜傾聽人民聲音與需求。從前年年底到今年年初的選舉中，國民黨輸了地方縣市長多數席次，也輸了國會多數黨地位，藍綠勢力一消一漲。
民主國家中，人民常以選票表示對執政當局的不滿，去年年底翁山蘇姬領導全國民主聯盟贏得緬甸國會大選，法國在野的共和黨打贏社會黨贏得了地方大區選舉，選舉失敗與勝利是民主的常態，回到台灣情形來看，執政黨國民黨如果一直選輸，甚至輸掉中央執政權，顯示民眾對馬政府的總體施政方向有諸多疑慮。
第二，選後，新國會在馬政府看守內閣期間，藍綠生態由於綠大於藍，在爭議性議題上可能產生對立之勢，例如屬民進黨掌握的國會將阻撓國民黨掌握的行政機關推行的法案，無法較為順利通過。民主政治即政黨政治，民意既選擇讓當前執政黨反省，因此選後藍綠兩派應在任何重大法案上達成更為負責任的審議與監督，國民黨應尊重民意並反省本身政策出了甚麼問題並作出適當修正，在下臺一鞠躬前留下漂亮身影，而民進黨則盡可能以準執政黨之姿做合理監督之責。
第三，從過去經驗看，政黨通常為選舉成敗負責，例如執政黨主席通常會負起敗選之責而辭職，國民黨主席朱立倫在敗選當晚已表明辭任黨主席。另外，目前的現行憲政體制似乎為修正式內閣制，因為憲法指明行政對立法負責，但總統民選且任期固定，而增修條文使總統在國安領域權限相當大，且可全權任命行政院長，常常使輿論認為實務上總統有權無責，是實質的總統制，從憲政意義上看，這次民進黨大贏只能促使國民黨內閣被動總辭，在舊政府看守過渡期中，產生新總統與現任總統的交鋒，使政府在施政上至少這半年內持續的不穩定。