台北地檢署15日就前總統馬英九一審判決無罪提起上訴，今天特別召開記者會，說明上訴理由，並認為一審判決若成為判例，恐造成「行政權會藉由操縱檢察權影響審判權」的危險。對此，馬英九辦公室發言人徐巧芯今（18）日則表示遺憾，呼籲北檢能夠依照證據辦案，切勿為了定人入罪而羅織罪名。
台北地方法院日前判馬英九教唆洩密無罪，北檢收到起訴書後，在上週五（15）提起上訴，今天針對上訴理由召開記者會。北檢指出，一審判決有違經驗及理論，認事及援引法條皆有重大違誤，若形成確定判決，勢必造成權力分立、司法獨立及人權保障等憲政價值門戶破裂洞開，有行政權藉由操縱檢察權影響審判權的危險。
對此，徐巧芯回應，我國元首依法處理「關說案」，卻演變成違法洩密，所謂的洩漏秘密，竟然是指民進黨立委柯建銘的關說醜聞。徐巧芯說，馬英九基於總統的權責，和時任行政院長江宜樺及幕僚討論憲政風暴的危機處理，竟遭人告發洩密，北檢卻也不提柯建銘的行為是否屬關說，且柯建銘指控馬英九「指揮辦案」亦非事實。
徐巧芯怒批北檢總是以憑空臆測的方式推論，直呼感到不可思議。她呼籲北檢辦案必須經得起檢驗、有憑有據。檢察官也應恪遵憲法、依據法律，本於良知，公正、客觀、超然、獨立、謹慎執行職務，切勿傷害人民對於司法公正的期待。
本案緣起係由特偵組召開記者會，指控前立法院長王金平替柯建銘關說司法案件，後來爆發馬英九、前檢察總長黃世銘等人洩密爭議，柯建銘因此向台北地方法院自訴馬英九。馬英九涉嫌透過秘書通知黃世銘前往總統官邸，提供關說案的監聽記錄和通聯紀錄教唆黃世銘洩密；馬英九也針對此事召開記者會，指控王金平、柯建銘關說，涉及加重誹謗罪。