蘇澳籍東半球28號漁船本月3、4日遭日本公務船緊追、噴水。駐日代表謝長廷今（22）日表示，政府處理的立場沒有軟弱，5日就向日方抗議，但日方隔天提出照片，證明漁船有釣魚、捕魚行為。「我們有抗議，他們也有抗議，但我們也不接受」，這要透過會議解決。
之後漁船要到那捕魚怎麼辦？謝長廷說，協議海域沒有問題，但要報備，但協議範圍以外就有風險，「透過一次一次協議，範圍可能會擴大，如果完全沒協議，我們的經濟海域到沖繩，他們到雲林。怎麼辦？不可能嘛！所以一定要協議」。
媒體詢問台日雙方是否各說各話？謝長廷說，通常有爭議就是這樣子，「我們內部同仁也有溝通」。至於「老戰友」游錫堃被點名選新北市長、是否為子弟兵輔選，謝長廷說「喔喔喔喔…，不方便講，等一下…」。
立法院外交及國防委員會今天邀請謝長廷、外交部長吳釗燮等人列席，報告「3月4日日本公務船噴水追趕我東半球28號漁船事件相關因應作為與台日海權爭議相關談判現況與進程」，並備質詢。
謝長廷報告時表示，駐日代表處5日向日方提出抗議，認為日方執法過當；但日方不接受，堅持是依法執行。因此，也要求日方提出證據。
他說，6日日方拿出3日拍到的照片，照片中可看到東半球28號有釣魚、捕魚的行為，還有2條魚。基於外交信賴，也不能提出反證的情況下，因此相信日方的證據。
謝長廷表示，日方認為3日要這艘漁船停船接受檢查，但漁船逃逸，4日又看到同一艘船，出現在台日漁業協議水域之外，因此實施緊追權。
首次列席外交及國防委員會備詢的吳釗燮則表示，駐日代表處第一時間的抗議，是基於日方在沒有充分證據下，就對台灣漁船實施緊追。即便在日方提出證據後，他認為抗議仍是有效的，日方應事先向台灣通報，也不應緊追漁船到台灣的暫定執法線內。
吳釗燮強調，處理漁船爭議，政府的立場沒有軟弱，一定會堅持立場。但因為雙方立場不同，需要時間持續協商。
國民黨立委呂玉玲質疑，日方有噴水、執法過當的情形，但吳釗燮報告中卻沒有「譴責」，只有「抗議」，「部長您認為有執法過當，他們是否有錯，不公正或欺負我們」？
吳釗燮表示，謝長廷報告已說明，「我們認為日方有執法過當」，後續要看證據來處理。
呂玉玲則批評，外交部、海巡署和漁業署報告中只有抗議，「為什麼不敢譴責」？吳釗燮則表示，提出嚴正抗議是正常外交的作法，但不認為有到達譴責的地步，「如果說造成傷亡的程度，再考慮是否譴責」，日方也提出（東半球28號）有違規的情形。
呂玉玲不斷追問「為何不譴責」，海巡署副署長胡意剛則解釋，「海巡署是執法機關，譴責的話，抗議是透過外交管道」。漁業署長黃鴻燕則說，在國際法上執行這樣的個案，噴水是一個被接受的手段。「通常在檢查時他有緊追權…」而呂玉玲認為已追了超過37海浬，漁業署應強勢來譴責才對。
黃鴻燕則回應，台日之間已有漁業協議，「任何處理應該用適當的手段，我們會感覺比較舒服…」，呂玉玲斥責說，「我們太軟弱了啦」，但黃馬上表示，「不是軟弱」，呂玉玲則接口，「要提高抗議嗎，還是就算了、沒了？」
藍委批立場軟弱 吳釗燮：從沒有軟弱過
黃鴻燕對此再解釋，「暫定執法線是我國自行劃定的一條線，但日本並沒有承認那條線，它自己有一個所謂的地理中線」，但呂認為日方太強硬，我們太軟弱，轉而質問謝長廷，「外交部有提抗議，我們用什麼方式抗議」？
對此謝長廷答復，代表處在執行這政策「不必外交部指示」，站在主權和國民權益我們就可以做，但要告知外交部。呂玉玲質問是否外交部有指示，吳釗燮則表示，有指示口頭抗議，「第一就是台日關係協會向台北的日台交流協會，直接到他們那邊去抗議，也要求駐日代表處正式向日方抗議」。
呂玉玲問抗議層級？吳釗燮則表示不便透露，「但層級不會多」，接著呂問謝長廷是跟誰抗議？謝長廷說，「部長以上」。呂玉玲說這樣抗議就無效，但謝強調「這才有效。去抗議會朗讀抗議書，在外面開記者會那都沒有用。」
台灣日本關係協會秘書長張淑玲說，上週在台北召開的台日漁業委員會中，雙方是有歧見，也多次重申台灣立場，雙方持續交涉，要求日方尊重台灣漁船的作業權益，不要輕易扣捕，造成台日雙方關係的影響。呂玉玲仍跳針質疑我方軟弱，但吳釗燮強調，從來沒有軟弱過，「就是因為堅持所以協議才會緩慢，就像之前台日談了15年才有結果」，呂玉玲則要求外交部一定要堅持、不要退讓。
針對東半球28號案，漁業署指出，該船的漁業執照為延繩釣漁業，在3月1到3日間進入台日漁業協議海域內及海域外作業捕魚，由於在此海域內作業必須事先申請核備，東船未經許可作業，已經違反「延繩釣漁船赴台日漁業協議適用海域作業管理辦法」第3條規定；而在台日漁業協議海域之外作業，因為位處雙邊主張的重疊經濟水域，超出政府劃設的暫定執法線，台灣漁船在這個水域作業也會惹出爭議。