教育部長吳茂昆今（29）天向行政院請辭獲准，行政院對此不回應，僅由吳茂昆發表個人聲明。對此，立法院教育及文化委員會、民進黨立委吳思瑤受訪時表示，國民黨因為台大校長遴選案不滿的情緒，衍生政治操作，把砲火集中在吳茂昆身上，不針對事件本質或政策監督，反而無限上綱對吳茂昆個人的事件進行「扒糞」式的羞辱，令人感到非常遺憾。
前教育部長潘文忠請辭，由吳茂昆接任，4月19日上任後爆發諸多爭議，國民黨立院黨團立委把砲火集中在吳茂昆身上，在壓力之下向行政院長賴清德口頭請辭獲准，僅上任40天。吳茂昆聲明指出，上任後即遭特定媒體「舖天蓋地」不實指控抹黑，還遭在野黨立委「極盡能事」羞辱，將他刻畫成一個惡質的人，他的一生從未遭受到如此嚴重的人格汚蔑與羞辱。
吳思瑤受訪時表示，對於吳茂昆請辭感到震驚與遺憾，她認為教育是百年大計，教育部長一直更迭，不利於教育政策推動，立法院即將休會，臨時會也沒有教育部重要的案子，希望內閣利用休會時間，在開議前慎選一個能順利推展教育政策的教長。
吳思瑤說，她可以理解吳茂昆的感受，並說國民黨對管中閔案不滿的情緒衍生的政治操作，把砲火集中在吳茂昆身上，都不是針對教育政策或是事件的本質去討論，反而對吳茂昆個人過去的事件攻擊，教育政策失焦，還無限上綱對吳進行「扒糞式」的羞辱，這種問政方式對教育推展顯然毫無幫助。
吳思瑤表示，可以理解吳茂昆承受的壓力和政治攻擊，這些都令人感到遺憾，她希望，未來新教育部長上任後，不要再出現有針對個人的攻擊，教育也不要政治化。
國民黨團書記長李彥秀則認為，吳茂昆擔任40天教育部長唯一的任務就是幫民進黨「拔管」，同時賠上台灣高教產業的競爭力與學術自由環境。李彥秀指出，為了一個台大校長遴選案，賠上了兩個教育部長，她反問民進黨「值得嗎？」她強調，民進黨應該要懸崖勒馬，尊重台大遴選委員會及校務會議的決定，讓教育部核准管中閔校長的聘任案。