學生突襲行政院後，原本打算在廣場前靜坐，但有一些情緒激動的民眾，更進一步翻窗進入行政院內，由於鎮暴警察已經開始集結，水車也在一旁待命，晚間9點30分，在場指揮的學生魏揚請在二樓的民眾離開建物，回到人群中一起靜坐，企圖緩和現場劍拔弩張的氣氛。
8點45分有民眾架梯爬進行政院內後，隨即傳出「警察打人」的喊聲，並傳出有人受傷。
9點13分，為讓受傷民眾獲得救護，維持秩序的學生請在場民眾讓出通道，讓救護車可以駛進現場，同時要求抗議民眾不要再翻窗進入建物內。
9點21分醫護人員進場。
9點22分，為了把傷患送出來，現場指揮同學不斷要求在場民眾，「請大家複誦我的話，請大家慢慢坐下，同時通道保持暢通。」。
9點29分，傳來警方半小時後不排除採取強制驅離的動作，在場指揮的同學立刻要求通道兩旁人站起來，手勾著手保持通道暢通，也要求大家注意黃色及紅色的車子，並提供教戰手冊指出，因水車的攻擊範圍是30公尺外，如果大家發現水車的蹤影，立刻上前包圍，以破解其攻勢，離水車越近越安全，同時切記保護眼睛!
9點33分，傳來門口有人昏倒的呼聲，徵求醫護人員前來協助。
9點36分，舞台及音控已架設完成，現場指揮的魏揚透過麥克風，呼籲在行政院二樓的人下來跟大家坐在一起，現在狀況還算穩定，如果二樓民眾不離開，鎮暴警察和水車都已在一旁待命，抗議民眾將守不住行政院，在場民眾也同聲呼喊「下來！」，魏揚也請醫護組到後門支援，其他民眾不要搶奪警察盾牌，希望大家就地靜坐，等待明天會有更多人來支援。
在場學生接著高喊「占領行政院，退回服貿」、「退回服貿，捍衛民主」。
10點15分，警察以雙重人牆圍住行政院，同時對行政院建物內及北平東路、天津街兩地的民眾，進行驅離。